Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GTF3C6Q969F1 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms