Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 PTPRD-AS1-201ENST00000430766 1959 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms