Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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