Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL4BQ13620 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms