Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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TOP3AQ13472 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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