Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
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TCOF1Q13428 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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TCOF1Q13428 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
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TCOF1Q13428 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
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TCOF1Q13428 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
TCOF1Q13428 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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