Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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