Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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SEMA3BQ13214 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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SEMA3BQ13214 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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SEMA3BQ13214 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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SEMA3BQ13214 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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SEMA3BQ13214 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3BQ13214 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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