Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CENPFP49454 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PTPRB-204ENST00000538708 5839 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CENPFP49454 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CENPFP49454 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CENPFP49454 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms