Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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HOXA13P31271 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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HOXA13P31271 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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HOXA13P31271 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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HOXA13P31271 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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HOXA13P31271 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXA13P31271 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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