Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 GCSAM-202ENST00000460387 623 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC209005.1-201ENST00000514043 464 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 IGKV2OR22-4-201ENST00000523309 367 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
LINC00587B1AMM8 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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LINC00587B1AMM8 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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LINC00587B1AMM8 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL606804.1-202ENST00000446347 481 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC009269.1-203ENST00000496414 828 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 TMEM150C-203ENST00000508701 566 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 IGLVI-70-201ENST00000523272 390 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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