Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SCN11AQ9UI33 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms