Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP34Q70CQ2 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 MAST4-204ENST00000405643 7713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC132825.3-201ENST00000562182 4710 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 DMBT1-203ENST00000344338 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 ZSCAN29-202ENST00000396976 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 MYH1-201ENST00000226207 6024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 NSD2-212ENST00000503128 8568 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 ELP4-218ENST00000639570 5795 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 ITGB6-211ENST00000620391 4401 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 EMP1-201ENST00000256951 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP34Q70CQ2 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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