Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC117382.1-201ENST00000468074 730 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC009309.1-201ENST00000610262 460 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC026468.1-201ENST00000614981 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL359745.1-201ENST00000626943 760 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 GPR15-201ENST00000284311 1252 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AP006193.1-201ENST00000440724 485 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms