Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms