Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms