Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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