Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms