Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACACAQ13085 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms