Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRCP08575 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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