Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms