Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCE1Q9Y256 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms