Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms