Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALKQ9UM73 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALKQ9UM73 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms