Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP8AP2Q9UKL3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms