Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEFF2Q9UIK5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEFF2Q9UIK5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms