Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNNA3Q9UI47 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA3Q9UI47 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms