Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MLH3Q9UHC1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MLH3Q9UHC1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms