Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLKQ9UBT6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms