Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARHGAP28Q9P2N2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms