Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms