Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms