Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.33
MBD5Q9P267 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD5Q9P267 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms