Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HCN3Q9P1Z3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms