Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD3Q9NX63 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms