Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC28Q9NX36 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms