Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L1Q9NU39 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4L1Q9NU39 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms