Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
PDS5BQ9NTI5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDS5BQ9NTI5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms