Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM167BQ9NRX6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms