Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUOX1Q9NRD9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms