Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IL1RAPQ9NPH3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IL1RAPQ9NPH3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms