Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms