Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4AQ9H788 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4AQ9H788 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4AQ9H788 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4AQ9H788 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4AQ9H788 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4AQ9H788 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4AQ9H788 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4AQ9H788 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4AQ9H788 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4AQ9H788 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D4AQ9H788 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SH2D4AQ9H788 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D4AQ9H788 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms