Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
YTHDC2Q9H6S0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms