Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCL3Q9H2J4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms