Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR1EQ9GZS1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR1EQ9GZS1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms