Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PUS3Q9BZE2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms