Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HIRIP3Q9BW71 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIRIP3Q9BW71 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms