Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms