Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KATNB1Q9BVA0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms